恶性疟、间日疟及三日疟，也用于治疗肠外阿米巴病、结缔组织病、光敏感性疾病(如日晒红斑)。 

　　治疗阿米巴脓肿：0.5g/次，2次/日，连服2日；后改为0.5g/日，连服2～3周为1疗程。本品极量1g/次，2次/日。常加服伯氨喹，以根治间日疟或消灭恶性疟配子体而防止传播，效果明显。

　　类风湿性关节炎：每日0.25-0.5g，待症状控制后，改为0.125g，一日2-3次，需服用6周至6月才能达到最大的疗效，可作为水杨酸制剂及递减肾上腺皮质激素时的辅助药物。 

　　儿童

　　口服1.间日疟：首次剂量按体重10mg/kg(以氯喹计算，以下同)，最大量不超过600mg，6小时后按体重5mg/kg再服一次，第2、3日每日按体重5mg/kg。

　　2.肠外阿米巴病：每日按体重口服10mg/kg(最大量不超过600mg)，分2-3次服，连服2周，休息一周后，可重复一疗程。 

　　儿童静脉滴注：脑型恶性疟：第1日为按体重18-24mg/kg(超过60kg哲沾60kg计算)，第2日按体重12mg/kg，第3日按体重10mg/kg。输液浓度为每0.5g磷酸氯喹加入10%葡萄糖注射液或5%葡萄糖氯化钠注射液500mL，滴入速度为每分钟12-20滴，第1日药量于8-12小时内一次滴完。 

　　个别病人用氯喹后，可引起药物性精神病。少数病人用药后，用于房室结及心肌的传导受抑制而引起心律失常，甚至发生阿－斯综合征以致心搏骤停，若抢救不及时，可造成死亡。